Enzymy mogą być zbud. z samego białka (np. trypsyna, ureaza, rybonukleaza), jednak w większości składają się z części białkowej (apoenzym) i niebiałkowej (małocząsteczkowe związki nieorg., atomy metali, pochodne witamin) tzw. grup prostetycznych i koenzymów. Niebiałkowe części enzymu pełnią w reakcjach enzymatycznych funkcję przenośników elektronów, określonych atomów lub ugrupowań chem. z jednego metabolitu na drugi. Enzymy katalizują reakcje termodynamicznie możliwe, zmniejszając jedynie energię aktywacji cząsteczek substratu, czyli energię niezbędną do przebiegu reakcji; przyspieszają dzięki temu osiągnięcie stanu równowagi reakcji. W czasie katalizy enzymatycznej cząsteczka substratu jest wiązana w określonym obszarze cząsteczki enzymu w tzw. centrum aktywnym,